Évaluation du prétraitement Le génotypage du VIH est nécessaire globalement pour orienter les programmes de traitement. Nous avons examiné l’association entre la résistance et le sous-type initial de médicament avec un échec virologique dans un essai clinique multinational randomisé qui évaluait les traitements ARV des traitements antirétroviraux et comprenait des sites à ressources limitées. réalisée dans une étude de cas-cohorte imbriquée incluant une sous-cohorte de participants échantillonnés aléatoirement, et des participants supplémentaires échouant dans un groupe de cas ART L’échec a été défini comme une charge virale confirmée VL & gt; copies / mL Cox modèles de risques proportionnels estimation de l’association résistance-échecRésultats Dans la sous-cohorte représentative / participants avec génotypes; % femmes; âge médian, années; nombre de cellules CD médian, cellules / μL; VL médian, copies de journal / mL; Dans la sous-cohorte et les groupes de cas combinés / participants avec génotypes, utilisés pour examiner l’association entre la résistance et l’échec du traitement, la résistance de base est survenue en%% avec échec ,% sans résistance à la ligne de base était significativement associée à un temps de réponse au risque d’échec virologique plus court [HR],; P =, et après ajustement pour le sexe, le bras de traitement, l’interaction du bras de traitement sexuel, le nombre de cellules CD de prétraitement, la LV de base et le sous-type, était encore indépendamment associé à HR; P = Comparé au sous-type B, l’infection de sous-type C était associée à un risque d’échec plus élevé HR; % intervalle de confiance [IC], -, alors que l’infection de sous-type non-B / C a été associée à plus de temps à l’échec HR,; % IC, -Conclusions Dans cet essai clinique global, la résistance au prétraitement et le sous-type du VIH étaient indépendamment associés à l’échec virologique. Le génotypage prétraitement doit être considéré chaque fois que possible. Enregistrement des essais cliniques NCT

Le VIH, la pharmacorésistance, le sous-type, l’essai cliniqueVoir le commentaire éditorial de Wainberg sur les pages -Les ressources limitées supportent de manière disproportionnée le fardeau mondial du virus de l’immunodéficience humaine VIH Le développement et la transmission des ARV antirétroviraux sont des obstacles majeurs. En tant que traitement antirétroviral, le traitement antirétroviral devient plus accessible dans les pays à ressources limitées , il est essentiel d’étudier la résistance aux antirétroviraux dans différents types de VIH et dans différents contextes afin de guider les soins cliniques. Dans de tels contextes, les tests de résistance de référence sont recommandés et rentables. Dans les pays à ressources limitées, l’OMS recommande la surveillance de la résistance de base uniquement au niveau de la population pour guider Stratégies programmatiques Avec l’intensification du déploiement des TAR, une augmentation significative de la résistance aux antirétroviraux est attendue avec le temps. les rapports montrent des taux modérés de résistance aux antirétroviraux% -% qui sont au moins en partie liés au suivi limité des patients sous traitement antirétroviral, à l’identification tardive des échecs antirétroviraux et à l’accumulation de résistances transmissibles Les données mondiales sur l’effet de la pharmacorésistance du VIH sur la réponse virologique au TAR de première intention, en particulier chez les personnes infectées par les sous-types VIH-non-B, sont limitées [, ] L’évaluation prospective des antirétroviraux dans les milieux à ressources limitées L’étude ACTG du groupe d’études cliniques PEARLS AIDS était un essai clinique du traitement antirétroviral initial réalisé entre et dans des pays couvrant plusieurs continents; La plupart des participants étaient dans des contextes à ressources limitées Ici, nous présentons les résultats d’analyses pré-planifiées de PEARLS de l’association de la résistance pré-ART avec les résultats du traitement.

Méthodes

Participants et conception de l’étude

PEARLS ClinicalTrialsgov NCT était un essai clinique ouvert, randomisé, de phase, multinationale, mené au Brésil, en Haïti, en Inde, au Malawi, au Pérou, en Afrique du Sud, en Thaïlande, aux États-Unis et au Zimbabwe. ans, infection par le VIH, nombre de CD & lt; cellules / μL, et ART naïf par autodéclaration et examen des dossiers médicaux & lt; jours d’exposition cumulative avant l’inscription Nevirapine unique sdNVP ou zidovudine ZDV pour la prévention de la transmission mère-enfant La PTME a été autorisée Pendant -, les participants éligibles ont été enrôlés et assignés aléatoirement aux bras de traitement: bras A: éfavirenz EFV co-régulé ZDV -lamivudine TC, n =; bras B: atazanavir ATV didanosine ddI emtricitabine FTC, n =; bras C: EFV coformulé fumarate de FTC-ténofovir disoproxil TDF, n = Pour la gestion de la toxicité ARV, l’étude a fourni les médicaments suivants comme substituts pour le traitement randomisé: stavudine ou TDF pour ZDV, ddI pour TDF, et NVP pour EFV suivi Le personnel qualifié du site a fourni des conseils d’adhésion à l’entrée de l’étude et au besoin par la suite en utilisant une liste de contrôle qui comprenait des informations couvertes sur l’observance, la formation motivationnelle et les compétences d’adhérence, par ex. Le protocole ne spécifiait pas que le counselling d’observance se produisait entre les mesures de la charge virale. Les données sur l’observance à chaque visite ont été recueillies par auto-évaluation à l’aide d’un questionnaire standardisé. administré dans les langues locales ACTG QOL, adapté de Chesney et al Les données d’observance au cours des premières semaines de suivi, c’est-à-dire avant la mesure initiale de l’échec virologique hebdomadaire, ont été résumées en une variable indicatrice dichotomique représentant soit aucun problème, soit quelques problèmes d’adhérence. n = Au lieu de cela, une étude de cas-cohorte imbriquée a été utilisée pour répondre aux objectifs de l’étude dans une grande cohorte dont le résultat, à savoir l’échec viral, était relativement rare. Les échantillons de base ont été obtenus: groupe de sous-cohorte: a sous-ensemble de participants choisis au hasard parmi la population totale de l’étude stratifiée par groupe de traitement et pays pour fournir une précision d’estimation similaire Ce groupe a été inclus dans l’estimation de la résistance de base et ses corrélats pour l’ensemble de la cohorte d’étude; Le groupe de cas n’a été inclus dans l’évaluation des associations entre la résistance de base et l’échec virologique. Pour cette analyse, le groupe de cas a été combiné avec le groupe de sous-cohorte pour former l’ensemble des cas. Étant donné que le groupe de sous-cohorte était un échantillon aléatoire choisi prospectivement sans tenir compte de l’échec virologique, le plan d’échantillonnage fournissait simultanément des estimations non biaisées de la résistance de base.

Figure Vue largeTélécharger Diagramme de flux des participants éligibles inclus dans l’analyse cas-cohorte Les participants du groupe sous-groupe sont un échantillon aléatoire représentatif des participants inscrits dans l’Évaluation prospective des antirétroviraux dans les milieux à ressources limitées étude PEARLS Les participants du groupe de cas Les participants qui ne font pas partie du groupe de sous-cohorte, qui ont connu un échec virologique Abréviation: ART, traitement antirétroviralFigure Voir grandTélécharger Diagramme des participants éligibles inclus dans l’analyse cas-cohorte Les participants du groupe sous-groupe sont un échantillon aléatoire représentatif des participants inscrits dans l’évaluation prospective des antirétroviraux dans les milieux à ressources limitées étude PEARLS Les participants du groupe de cas sont des participants qui ne font pas partie du groupe sous-groupe, qui ont connu une défaillance virologique Abréviation: ART, traitement antirétroviral

Méthodes de laboratoire

Les prélèvements de plasma ont été stockés pour le génotypage. Le génotypage de Pol a été effectué rétrospectivement dans des laboratoires régionaux qui ont participé à l’Institut National des Allergies et des Maladies Infectieuses Division NIAID du SIDA Programme d’assurance qualité de la virologie utilisant le système de génotypage du VIH ViroSeq Celera Diagnostics, Alameda, Californie Le réseau des essais de prévention du VIH Le centre de laboratoire HPTN a coordonné le génotypage

Analyse de séquence

Les mutations de résistance ont été évaluées en utilisant la liste de mutation OMS Les sous-types VIH ont été déterminés par analyse phylogénétique, en utilisant PHYLIP DNADIST et les programmes voisins , avec des séquences de référence de la base de données LANL du laboratoire national de Los Alamos. de coefficients de distance génétique, le sous-type de la séquence de référence la plus proche a été pris comme sous-type probable Les séquences avec des sous-types ambigus ont été revues et classées manuellement par le programme d’identification recombinante LANL

Méthodes statistiques

L’association de la résistance de base avec d’autres caractéristiques initiales des participants a été évaluée dans le groupe de sous-cohorte. Caractéristiques: sexe, race, âge, nombre de cellules CD et prétraitement, sous-type, pays, antécédents de sida ou de tuberculose, sérologie hépatite B et antirétroviraux utilisation pour la PTME Fisher tests exacts pour les variables catégoriques ou test de Wilcoxon pour les variables continues testés association entre les caractéristiques et la présence de résistance de base Estimations de prévalence utilisées méthodes exactes Clopper-Pearson pour l’intervalle de confiance Calculs CI L’échec virologique confirmé a été défini comme ayant des LV consécutives & gt; copies / mL ≥ semaines après la randomisation L’association entre la résistance et l’échec virologique initial confirmé a été testée dans la cohorte entière. Pour modéliser correctement le plan d’échantillonnage cohorte-cas, un modèle de Cox à risques proportionnels utilisant la pondération inverse a été étudié pour étudier les modèles multivariés. construit volontairement ie, demande d’investigateur pour l’inclusion covariable, et test si la résistance a modifié l’effet du traitement pour l’échec virologique utilisé un terme d’interaction et degrés de liberté Test de WaldLa taille prévue du groupe de sous-cohorte n = était basée sur les hypothèses suivantes: dans la cohorte d’étude complète; échec virologique chez% des participants de la cohorte de l’étude complète; Sur la base de ces hypothèses, la conception de cas-cohorte a eu le pouvoir de détecter un rapport de risque HR de ou supérieur pour l’échec virologique entre ceux avec vs ceux sans résistance Utilisant la même prévalence présumée de résistance, la précision estimée sur la prévalence de la résistance dans n’importe quel pays n = environ les participants ont été estimés à environ un point de pourcentage ou approximativement à un point de pourcentage entre les pays Toutes les analyses statistiques ont été effectuées en utilisant la version SAS sur la plateforme UNIX

RÉSULTATS

Participants à l’étude

Parmi les participants,% ont été inclus dans la cohorte complète. Figure Génotypage réussi pour des% des participants du groupe sous-groupe échec du traitement antirétroviral et pour% des participants supplémentaires dans le groupe de cas échec du traitement antirétroviral et cohorte de cas complète sont présentés dans le tableau

Tableau Données démographiques de base et caractéristiques cliniques des participants à l’étude ayant des résultats de génotypage Variable Sous-cohorte aléatoire n = Cohorte complète N = Sexe masculin%% Race Asiatique%% Noir ou Afro-américain%% Blanc%% Amérindien%% Autre%% Inconnu%% Âge , y, gamme moyenne – – VL, copies de journal / mL, gamme moyenne – – nombre de CD, cellules / μL, gamme moyenne – – Groupe de traitement A EFVTCZDV%% B ATVddIFTC%% C EFVFTCTDF%% Région géographique Afrique%% Amérique du Sud %% Asie%% États-Unis%% Caraïbes%% Sous-type / CRF C%% B%% CRF_AE%% F%% CRF_AG%% Othera%% Variable Sous-cohorte aléatoire n = Cohorte complète N = Sexe masculin%% Race Asiatique% % Noir ou Afro-Américain%% Blanc%% Amérindien%% Autre%% Inconnu%% Âge, y, moi une plage – – VL, copies de journal / mL, gamme moyenne – – nombre de CD, cellules / μL, gamme moyenne – – bras de traitement A EFVTCZDV%% B ATVddIFTC%% C EFVFTCTDF%% Région géographique Afrique%% Amérique du Sud%% Asie %% États-Unis%% Caraïbes%% Sous-type / CRF C%% B%% CRF_AE%% F%% CRF_AG%% Othera%% Abréviations: TC, lamivudine; ATV, atazanavir; CRF, forme recombinante circulante; ddI, didanosine; EFV, éfavirenz; FTC, emtricitabine; TDF, fumarate de ténofovir disoproxil; VL, charge virale; ZDV, zidovudinea Sous-cohorte aléatoire: CRF_BF, CRF_BC; cohorte complète: A, CRF_BF, CRF_B, CRF_BC Agrandir l’image

Résistance de base dans le groupe de sous-groupe et le groupe de cas

Dans le groupe de sous-cohorte, au moins une mutation de résistance a été identifiée chez% des participants% [CI],% -% IDs, Tableau; avait des mutations NRTI de l’inhibiteur nucléosidique de la transcriptase inverse, avait des mutations NNRTI de l’inhibiteur non nucléosidique de la transcriptase inverse, et avait des mutations PI de l’inhibiteur de la protéase Six des% étaient infectés par des sous-types non B; Aucune des antécédents de TAR signalés La prévalence de la résistance n’a pas varié significativement selon le pays Tableau Aucune des caractéristiques de base examinées dans le tableau n’était significativement associée à la résistance, globale ou par classe de médicaments ARV. adhérence à ART

Tableau Baseline Mutations de résistance aux médicaments selon le bras de traitement, le pays et le sous-type ID Groupe de traitement Sous-type de pays NRTI NNRTI PI Sous-groupe de cohortes A EFVTCZDV Inde C LIL Thaïlande AE ​​DN, KQ US B MLM US B MLM B ATVddIFTC Haïti B MI a Malawi C IIV a Malawi C KN Afrique du Sud C TADNT C EFVFTCTDF Pérou B ML, LW, TD Thaïlande AE ​​TS US B TS Cas du groupe A EFVTCZDV Malawi C MV, TNSTY KN, C Malawi C KKN Afrique du Sud C KKN b Afrique du Sud C KKN B ATVddIFTC Brésil B KN Haïti B KKN Inde C MV KEK, YCY, GS Malawi C MV VAV b Malawi C MV YC Malawi C MV KN États-Unis B KKN C EFVFTCTDF Brésil B KKN Brésil F KKN Haïti B TFIST YL Malawi C MV KE, GA Malawi C KR, YFY, MV KN, VM b Pérou B KRS b Afrique du Sud C KE Thaïlande AE ​​KN, GAG US B KR LI US B YL US B KN ID Bras de traitement Pays Sous-type NRTI NNRTI PI Sous-groupe de sous-groupe A EFVTCZDV Inde C LIL Thaïlande AE ​​DN, KQ US MLM US B MLM B ATVddIFTC Haïti B MI a Malawi CIIV a Malawi C KN Afrique du Sud C TADNT C EFVFTCTDF Pérou B ML, LW, TD Thaïlande AE ​​TS US B TS Cas du groupe A EFVTCZDV Malawi C MV, TNSTY KN, C Malawi C KKN Afrique du Sud C KKN b Sud Afrique C KKN B ATVddIFTC Brésil B KN Haïti B KKN Inde C MV KEK, YCY, GS Malawi C MV VAV b Malawi C MV YC Malawi C MV KN États-Unis B KKN C EFVFTCTDF Brésil B KKN Brésil F KKN Haïti B TFIST YL Malawi C MV KE, GA Malaw i C KR, YFY, MV KN, VM b Pérou B KRS b Afrique du Sud C KE Thaïlande AE ​​KN, GAG É.-U. B KR LI É.-U. B US L KN Groupe de sous-groupe: ID -; groupe de cas: ID – Les numéros d’identification des participants qui ont échoué au premier moment disponible sont soulignés. Participants ayant des mutations non associées aux schémas initiaux: ID, remplacé par ZDVTCEFV après des semaines dans le régime d’étude et des semaines échouées après le changement de régime; ID, commuté à ddIFTCEFV après des semaines sur le régime d’étude et a échoué semaines après ce changement de régime; ID, commuté à ddIFTCEFV après des semaines sur le régime d’étude et échoué semaines après le changement de régime; Les participants suivants ont reçu des médicaments antirétroviraux pour la prévention de la transmission de la mère à l’enfant PTME du VIH avant l’enrôlement: ID, a reçu une dose unique de névirapine sdNVP semaines avant l’inscription; ID, reçu semaines sdNVP avant l’inscription; ID, reçu en monothérapie ZDV – semaines avant l’inscription; ID, reçu semaines sdNVP avant l’inscriptionAbbreviations: TC, lamivudine; ATV, atazanavir; ddI, didanosine; EFV, éfavirenz; FTC, emtricitabine; VIH, virus de l’immunodéficience humaine; ID, numéro de participant; INNTI, inhibiteur non nucléosidique de la transcriptase inverse; NRTI, inhibiteur nucléosidique de la transcriptase inverse; PI, inhibiteur de protéase; TDF, fumarate de ténofovir disoproxil; ZDV, zidovudinea Participants au groupe sous-groupe qui ont échoué ultérieurement au traitementb Participants ayant déjà été exposés à des antirétroviraux pour la PTME voir le texte dans la note ci-dessus pour plus de détailsView Large

Tableau Estimation de la prévalence de la résistance de base dans la sous-cohorte Aucune estimation de la prévalence% CI pour la prévalence% en% -% Pays P = Brésil% NA Haïti%% -% Inde%% -% Malawi%% -% Pérou%% -% Afrique du Sud% % -% Thaïlande%% -% États-Unis%% -% Zimbabwe% NA Sous-type P = B%% -% C%% -% Non-B, non-C%% -% Aucune estimation de prévalence% CI pour la prévalence globale% % -% Pays P = Brésil% NA Haïti%% -% Inde%% -% Malawi%% -% Pérou%% -% Afrique du Sud%% -% Thaïlande%% -% États-Unis%% -% Zimbabwe% NA Sous-type P = B%% -% C%% -% Non-B, non-C%% -% Abréviations: IC, intervalle de confiance; NA, sans objetView Large Dans le groupe de cas, au moins une mutation de résistance a été identifiée dans% ID de participants -, Tableau Tous les participants avaient ≥ mutation NNRTI,% avaient ≥ mutation NRTI, et% avaient une résistance à deux classes Quatre des participants ont déclaré avoir reçu Médicaments ARV pour la PTME

Association de la résistance de base et de l’échec virologique

Les résultats d’échec virologique par résistance, sous-type et bras de traitement ont été évalués en utilisant la cohorte de cas complète N =; Tableau Au moins la mutation de résistance a été détectée dans% des échantillons provenant de participants avec échec virologique et de% échantillons provenant de participants sans échec virologique Parmi les participants avec résistance qui ont échoué ART,% avaient une résistance aux INNTI,% avaient une résistance aux INTI et% % des participants présentant une résistance ayant échoué ont eu des mutations associées à des médicaments dans leur schéma thérapeutique initial. Les participants n’ayant pas ID,, et qui étaient en traitement B et qui présentaient la mutation de base associée à l’EFV, KN Trois de ces participants ont changé à un régime contenant EFV avant l’échec de l’ART

Tableau Résultats d’échec virologique par ligne de base Résistance, sous-type et traitement Groupe d’extrants Sous-groupe Groupe Cas No Total VL Echec VL Echec VL Echec Cohorte complète Aucune résistance Toute résistance Total Modèle, Résistance uniquement: HR, [% CI, -] Sous-type Sous-type B Tous Aucune résistance Toute résistance Sous-type C Tous Aucune résistance Toute résistance Autres sous-types Tous Aucune résistance Toute résistance Modèle, résistance contrôlant pour sous-type: HR, [% CI, -] Bras de traitement Bras A: EFVTCZDV Tous Aucune résistance Aucune résistance Arm B: ATVddIFTC Tous Pas de résistance Toute résistance Bras C: EFVFTCTDF Tous Pas de résistance Toute résistance Modèle, résistance contrôlant pour les traitements t bras: HR, [% CI, -] Résultat Subcohort Groupe Groupe de cas Total Non VL Echec VL Echec VL Echec Cohorte complète Aucune résistance Aucune résistance Total Modèle, Résistance uniquement: HR, [% CI, -] Sous-type B Tout Non résistance Toute résistance Sous-type C Tous Aucune résistance Toute résistance Autres sous-types Tous Aucune résistance Toute résistance Modèle, résistance contrôlant pour sous-type: HR, [% CI, -] Bras de traitement Bras A: EFVTCZDV Tous Aucune résistance Aucune résistance Arm B: ATVddIFTC Tous Aucune résistance Toute résistance Arm C: EFVFTCTDF Tous Aucune résistance Toute résistance Modèle, contrôle de la résistance pour le bras de traitement: HR, [% CI, -] Abréviations: TC, lamivudine; ATV, atazanavir; CI, intervalle de confiance; ddI, didanosine; EFV, éfavirenz; FTC, emtricitabine; HR, hazard ratio; TDF, fumarate de ténofovir disproxil; VL, charge virale; ZDV, zidovudineView Large Quatre-vingts des participants ayant échoué ont eu un échec de l’ART à la première visite de la semaine. Onze de ces% avaient une résistance de base Tableau Le temps médian à l’échec virologique parmi ceux qui ont échoué était le quinzième percentile: semaines et temps médian à la confirmation de l’échec de l’ART était semaines intervalle interquartile [IQR], – semaines Parmi les participants sans résistance de base, médiane VL à l’échec était log copies / ml IQR, – log copies / ml Parmi les participants avec résistance, la médiane VL à l’échec était des copies de journal / mL mL, – les copies log / mL de LV au moment initial ou à la confirmation n’étaient pas significativement associées à la résistance ou au traitement. Les participants à la chimiothérapie échouaient à des cellules / μL IQR, – cellules / μL, et le changement médian de prétraitement Le nombre de cellules CD était de cellules / μL IQR, – cellules / μL Parmi les participants sans résistance qui ont échoué ART, ces valeurs étaient des cellules / μL IQR, – cellules / μL et cellules / μL IQR, – cellules / μL, respectivement. Parmi les participants présentant une résistance, ces valeurs étaient les cellules / μL IQR, – cellules / μL et cellules / μL IQR, – cellules / μL, respectivement La distribution des changements dans le nombre de cellules CD du prétraitement à l’échec virologique n’était pas significativement associé à la résistance P = Dans un modèle de risques proportionnels de Cox pondéré univariable, la résistance de base était significativement associée à un échec virologique et à un délai plus court pour l’échec virologique HR, [% CI, -; P =] Après ajustement pour le sexe, le bras de traitement, l’interaction du bras de traitement sexuel, le nombre de cellules CD de prétraitement, la LV de base et le sous-type, la signification restait HR, [% IC, -]; P = Dans le même modèle multivariable, le sous-type était indépendamment associé à l’échec virologique P = Comparé au sous-type B, l’infection non sous-type C / non-sous-type B était protectrice contre l’échec HR [% CI, -], alors qu’il y avait un non significatif Dans un modèle multivarié, s’ajoutant en outre au changement du nombre de cellules CD et à l’auto-évaluation de la non-observance au cours des premières semaines, la résistance de base reste significativement associée à échec virologique et délai d’échec HR, [% CI, -] Sous-type était de nouveau indépendamment associé à l’échec virologique et au délai d’échec virologique: l’infection de sous-type C était associée à un temps de réponse plus court à HR [% CI, -] et l’infection avec d’autres sous-types non-B, non-C était associée à un délai plus long à l’échec HR, vs sous-type B [% CI, -] Il n’y avait aucune évidence statistiquement significative que l’effet du traitement pour VL était initialement observé dans l’étude a été modifié par la résistance de base P = pour l’interaction

DISCUSSION

Cependant, nous avons constaté que les personnes infectées par le sous-type C étaient plus susceptibles d’échouer le traitement antirétroviral et d’échouer plus tôt que celles infectées par le sous-type B Bien que le sous-type du VIH ne soit pas actuellement Certains rapports suggèrent qu’il pourrait être associé à la progression de la maladie et au développement de la pharmacorésistance [,,], alors que d’autres ne sont pas d’accord Une controverse similaire existe particulièrement pour le sous-type C soutenir l’association du sous-type VIH, en particulier le sous-type C globalement prédominant, avec échec viral. Le sous-type C a été associé à une mutation unique NNRTI, VM , augmentation de la mutation NRTI KR , et résistance globale NRTI et NNRTI prévalence Des différences dans les types et la fréquence de mutations spécifiques de résistance aux médicaments ont également été notées pour d’autres sous-types de VIH Ces différences refléter les différences de sous-type dans les séquences de protéase du VIH, de transcriptase inverse et d’autres protéines virales ciblées par les ARV Ces différences peuvent influencer les résultats du traitement et la prévalence de la pharmacorésistance dans les régions où prédominent différents sous-types. Étude PEARLS; D’autres études sont prévues pour évaluer la fréquence et l’impact des variants de résistance minoritaires . Des recherches continues sur les différences d’échec et de pharmacorésistance liées au sous-type sont justifiées, d’autant que le sous-type peut être confondu avec d’autres facteurs non contrôlés. L’effet des mutations spécifiques de résistance aux médicaments varie également Les mutations telles que KN et MV, qui confèrent une résistance élevée aux médicaments et une résistance à de multiples médicaments, ont des implications plus importantes sur les options de traitement et les résultats que les mutations associées aux faibles Le génotypage pré-ART est rentable aux États-Unis où la prévalence estimée de la résistance aux médicaments transmise est de & gt;% , mais ce n’est pas systématique dans la plupart des contextes où les ressources sont limitées. l’infrastructure et les contraintes de coûts, mais aussi le manque de données documentant l’utilité et la rentabilité Les tests de résistance antirétroviraux, en particulier dans les contextes à faible prévalence de VIH pharmacorésistant, devraient augmenter dans les pays à ressources limitées, à mesure que les niveaux de résistance augmenteront avec l’intensification du traitement antirétroviral. Il est important de noter que Cette étude a été menée dans le cadre d’un essai clinique, avec une surveillance fréquente de la LV, ainsi que d’autres évaluations d’adhérence et d’observance. Il sera également important de mener des analyses similaires de la résistance de base et des résultats ART dans les milieux cliniques non restreints. où les éléments clés des soins VIH, tels que la surveillance du nombre de lymphocytes VL et CD, ne sont pas routiniers Une limitation de notre étude est que certains participants peuvent avoir déjà été exposés aux ARV et ne le savaient pas ou ont choisi de ne pas divulguer cette information. information au moment de l’inscription Il n’est donc pas possible de conclure que tous les cas de résistance de base étaient dus à une résistance aux médicaments transmise. a été documentée dans d’autres études, y compris un essai effectué sur certains des mêmes sites que PEARLS Une autre limite de cette étude est que la résistance pré-ART peut avoir été sous-estimée en raison de la mutation et de la réversion chez les participants de longue date. Infection par le VIH Le génotypage a également été réalisé en utilisant le séquençage de la population, qui peut ne pas détecter les variants de faible niveau du VIH présentant des mutations pharmacorésistantes De plus, des échantillons de référence PEARLS ont été recueillis. Enfin, comme la fréquence de la résistance de base était relativement faible dans la sous-cohorte, certaines analyses ont été conçues pour identifier les sous-populations les plus susceptibles de bénéficier du génotypage pré-ART, par exemple les analyses de l’association résistance de base Le sous-type et la géographie étaient limités en raison du petit nombre absolu de personnes ayant le résultat de la résistance de base. En résumé, Bien que la prévalence de la résistance de base reste faible dans de nombreux contextes, une surveillance continue est nécessaire, en particulier dans les régions avec des programmes ou des plans pour l’intensification de l’ART. Cette étude aidera à éclairer les décisions politiques liées à l’utilisation des tests de résistance dans la pratique clinique dans les pays à ressources limitées. Les résultats du rapport soutiennent l’utilisation du génotypage avant l’initiation du TAR dans les pays à ressources limitées. , quand c’est faisable

Remarques

Remerciements Les auteurs remercient l’équipe d’étude et les participants d’avoir fourni des échantillons et des données pour ce travail. Les auteurs remercient également le personnel de laboratoire de chacune des institutions participantes de leur aide pour la gestion et le test des échantillonsDisclaimer Le contenu relève uniquement de la responsabilité des auteurs. Soutien financier Ce travail a été soutenu par le Centre de statistiques et de gestion des données de l’ACTG, sous le numéro de subvention NIAID UMAI et le numéro UMAI de subvention de leadership. ; Les sponsors pharmaceutiques de cette étude comprenaient Boehringer Ingelheim, Bristol-Myers Squibb, Gilead Sciences et les conflits d’intérêts GlaxoSmithKlinePotential. TBC a été consultant pour Gilead Sciences. Un consultant pour Celera et a reçu des honoraires de AbbVie et Merck JWM est un consultant pour Gilead Sciences et un actionnaire de RFS Pharmaceuticals TF possède des actionnaires de Boehringer Ingelheim, Bristol-Meyers Squibb, Gilead Sciences, et GlaxoSmithKline ALR est un partenaire employé à temps chez Janssen Pérou Tous les autres auteurs ne signalent aucun conflit potentiel Tous les auteurs ont soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des conflits d’intérêts potentiels Conflits que les éditeurs considèrent pertinents pour le contenu du manuscrit ont été divulgués